Федоренко Віктор Олександрович



Завідувач кафедри генетики та біотехнології, доктор біологічних наук,
професор
Науковий керівник НДЛ генетики, селекції та
генетичної інженерії біологічно активних речовин і Колекції культур
мікроорганізмів-продуцентів антибіотиків ЛНУ ім. І.Франка
Голова Львівського обласного відділення та член Президії правління
Українського товариства генетиків і селекціонерів імені М. Вавилова
Головний редактор журналу «Вісник Львівського
університету. Серія біологічна»
Член редколегій журналів «Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів
імені М. Вавилова», «Studia Biologica» і «Мікробіологія і біотехнологія»
Член науково-методичної комісії Міністерства освіти і науки України
з біотехнології
Член спеціалізованих вчених рад із захисту дисертацій:
 Д 35.246.01 в Інституті біології клітини НАН України
Д. 41.051.06 в Одеському національному університеті імені І.І. Мечнікова Керівник наукового семінару кафедри генетики та біотехнології
Куратор студентського наукового товариства "Генетичний клуб"
Телефони: +038-032-2394768, +038-032-2394407
Телефон/факс +038-032-2394475
Електронна пошта: v_fedorenko@franko.lviv.ua



       Народився в 1951 році. Закінчив з відзнакою у 1973 році Львівський університет ім. І.Франка та у 1979 році - аспірантуру у Всесоюзному науково-дослідному інституті генетики та селекції промислових мікроорганізмів (Москва). У 1981 році захистив в цьому інституті кандидатську дисертацію на тему "Генетична нестабільність ознак стійкості до антибіотиків у Strepomyces coelicolor A3(2)"(науковий керівник - проф. Ломовська Н.Д.), а у 2005 - в Інституті клітинної біології та генетичної інженерії НАН України (м.Київ) докторську дисертацію "Генетичний контроль стійкості актиноміцетів до антибіотиків та його роль у біосинтезі антибіотиків". З 1979 року працює на кафедрі генетики та біотехнології ЛНУ ім. І.Франка. Вчений ступінь доцента отримав в 1985 році. Завідувач кафедри генетики та біотехнології з 1994 року. Стажувався в Московському університеті, Державному науковому центрі антибіотиків (Москва) та Інституті дослідження природних сполук (Йєна, ФРН). Читає загальні курси "Генетика", "Основи біотехнології" для студентів біологічного факультету ЛНУ ім. І.Франка, спецкурси "Молекулярні механізми генетичних процесів", "Генетика мікроорганізмів", "Генетична інженерія", "Методи молекулярного клонування" та проводить практикум з генетики та генетичної інженерії мікроорганізмів для студентів кафедри генетики та біотехнології. Є автором навчальних посібників "Великий практикум з генетики, генетичної інженерії та аналітичної біотехнології мікроорганізмів" і "Задачі та вправи з генетики". Отримав гранти Соросівського доцента в 1995 та 1997 роках. Під його керівництвом виконано понад 20 науково-дослідних проектів у тому числі міжнародних і захищено 12 кандидатських дисертацій. Федоренко В.О. є автором більше 260 наукових публікацій і 5 патентів на винаходи. Галузі наукових інтересів - генетика, селекція та генетична інженерія актиноміцетів, генетичний контроль біосинтезу антибіотиків та стійкості до антибіотиків, механізми нестабільності геному бактерій.


Список основних публікацій за 2004-2009 роки:

  1. Ostash B., Doud E., Fedorenko V. The molecular biology of moenomycins: towards novel antibiotics based on inhibition of bacterial peptidoglycan glycosyltransferases. Biol Chem. 2010. – Vol.391, N5. – P.499 – 504.
  2. Ostash B., Ostash I., Zhu L., Kharel M.K., Luzhetskyy A., Behthold A., Walker S., Rohr J., Fedorenko V. Properties of lank-based regulatory circuit involved in landomycin biosynthesis in Streptomyces cyanogenus. Rus J Genet.- 2010. Vol.46,N5.- P.530-535. [pdf, 347Kb]
  3. Myronovskyy M.L., Ostash B.E., Fedorenko V.A. Diversity of genes encoding nonribosomal peptide synthetases in the Streptomyces sioyaensis genome. Rus J Genet. – 2010. – Vol.46, N7. - P.791-797.
  4. Makitrynskyy R., Rebets Y., Ostash B., Zaburannyi N., Rabyk M., Walker S., Fedorenko V. Genetic factors that influence moenomycin production in streptomycetes. J Ind Microbiol Biotechnol. – 2010. – Vol.37, N6.- P.599-566.
  5. Horbal L., Rebets Y., RabykM., Luzhetskyy A., Welle E., Ostash B., NakamuraT., Fedorenko V., Bechthold A. Characterization and analysis of the regulatory network involved in control of lipomycin biosynthesis in Streptomyces aureofaciens Tu117 // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2010. – Vol.85,N4. – P.1069-1079.
  6. Zaburannyy N., Ostash B., Fedorenko V., TTA Lynx: a web-based service for analysis of actinomycete genes containing rare TTA codon // Bioinformatics – 2009. – Vol.25, N.18 – P.2432 – 2433.
  7. Ostash B., Makitrinskyy R., Walker S., Fedorenko V. Identification and characterization of Streptomyces ghanaensis ATCC14672 integration sites for three actinophage-based plasmids // Plasmid – 2009. – Vol.61,N3.- P.171-175.
  8. Myronovskyy M., Ostash B., Ostash I., Fedorenko V. A gene cloning system for the siomycin producer Streptomyces sioyaensis NRRL-B5408 // Folia Microbiologica – 2009. - Vol. 54, №2 – Р. 91-96.
  9. Kobylyanskyy A., Ostash B., Fedorenko V. Heterologous cross-expression of oxygenase and glycosyltransferase genes in streptomycetes, producing angucyclic antibiotics // Cytology and Genetics – 2009.- Vol.43,N3. – P.194-200.
  10. Ostash B., Korynevska A., Stoika R., Fedorenko V. Chemistry and biology of landomycins, an expanding family of polyketide natural products // Mini-Rev. Med. Chem. – 2009. – Vol.9, N9. – P. 1040 – 1051.
  11. Rebets Y., Horbal L., Boll R., Fedorenko V., Bechthold A. Production of аvilamycin A is regulated by AviC1 and AviC2, two transcriptional activators // J. Antibiot. – 2009. – Vol.62, N8 - P. 461 – 464.
  12. Rebets Y., Dutko L., Ostash B., Luzhetskyy A., Kulachkovskyy O., Yamaguchi T., Nakamura T., Bechthold A., Fedorenko V. Function of lanI in regulation of landomycin A biosynthesis in Streptomyces cyanogenus S136 and cross-complementation studies with Streptomyces antibiotic regulatory proteins encoding genes // Arch Microbiol. – 2008. – Vol.190, N1. – P.105 – 109. [pdf, 455Kb]
  13. Ostash I, Rebets Y, Ostash B, Kobylyanskyy A, Myronovskyy M, Nakamura T, Walker S, Fedorenko V. An ABC transporter encoding gene lndW confers resistance to landomycin E // Arch Microbiol. – 2008. – Vol.190, N1. – P.105 – 109. [pdf, 291Kb]
  14. Ostash I., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Walker S., Fedorenko V. Coordination of export and glycosilation of landomycins in Streptomyces cyanogenus S136 // FEMS Microbiol. Lett. – 2008. – Vol.285, N2. – P.195 – 202. [pdf, 284Kb]
  15. Федоренко В.О., Черник Я.І., Максимів Д.В., Боднар Л.С. Задачі та вправи з генетики. – Львів: Оріяна Нова, 2008. – 598 с.
  16. Ostash I., Ostash B., Walker S., Fedorenko V. Proton-dependent transporter gene, lndJ, confers resistance to landomycin E in Streptomyces globisporus // Rus. J. Genet. –2007. – Vol.43,N8. – P.852-857.
  17. Федоренко В.О., Осташ Б.О., Гончар М.В., Ребець Ю.В. Великий практикум з генетики, генетичної інженерії та аналітичної біотехнології мікроорганізмів. – Львів: Видавн. центр ЛНУ імені Івана Франка, 2007. – 279 с.
  18. Климишин Д.О., Громико О.М., Федоренко В.О. Використання міжродової кон’югації Escherichia coli-Streptomyces для перенесення рекомбінантних ДНК в штам Streptomyces nogalater IMET 4360 // Цитология и генетика. – 2007. – Т.41,№5. – С. 263 – 267.
  19. Dutko L.,Rebets Y.,Ostash B.,Luzhetskyy A.,Bechthold A., Nakamura T., Fedorenko V. A putative proteinase gene is involved in regulation of landomycin E biosynthesis in Streptomyces globisporus 1912 // FEMS Microbiol. Letters-2006.-Vol. 255, Is.2. -P.280 - 285 [pdf, 149Kb].
  20. Rebets Y., Ostash B., Fukachara M., Nakamura T., Fedorenko V. Expression of the regulatory protein LndI for landomycin E production in Streptomyces globisporus 1912 is controlled by the availability of tRNA for the the rare UUA codon // FEMS Microbiol. Letters-2006.-Vol. 256, Is.1. -P.30 - 37 [pdf, 451Kb].
  21. Luzhetskyy A., Fedoryshyn M., Gromyko O., Ostash B., Rebets Y., Bechthold A., Fedorenko V. IncP plasmids are most effective in mediating conjugation between Escherichia coli and Streptomycetes // Генетика -2006. - Т.42, N5.- С.595-601 [pdf, 210Kb].
  22. Baig I., Kharel M., Kobylyanskyy A., Zhu L., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Bechthold A., Fedorenko V., Rohr J. On the acceptor substrate of C-glycosyltransferase UrdGT2: three prejadomycin C-glycosides from an engineered mutant of Streptomyces globisporus 1912 delta lndE(urdGT2) // Angew. Chem. Int. Ed. - 2006.-Vol.45.- P.7842-7846 [pdf, 240Kb].
  23. Rebets Yu., Ostash B., Luzhetskyy A., Kushnir S. , Fukuhara M., Bechthold A., Nashimoto M., Nakamura T., Fedorenko V. DNA-binding activity of LndI protein and temporal expression of the gene that upregulates landomycin E production in Streptomyces globisporus 1912 // Microbiology.-2005.-Vol. 151, N1.-P. 281-290 [pdf, 876Kb].
  24. Zhu L., Ostash B., Rix U., Nur-E-Alam M., Mayers A., Luzhetskyy A., Mendez C., Salas J.A., Bechthold A., Fedorenko V., Rohr J. Identification of the function of gene lndM2 encoding a bifunctional oxygenase-reductase involved in the biosynthesis of the antitumor antibiotic landomycin E by Streptomyces globisporus 1912 supports the originally assigned structure for landomycinone // J.Org.Chem.- 2005.- Vol.70, N2.- P.631-638 [pdf, 209Kb].
  25. Luzhetskyy A., Zhu L., Gibson M., Fedoryshyn M., Durr C., Hofman C., Hoffmeister D., Ostash B., Mattingly C., Adams V., Fedorenko V., Rohr J., Bechthold A. Generation of novel landomycins M and O through targeted gene disruption //ChemBioChem.-2005.-Vol.6,N4.-P.675-678 [pdf, 87Kb].
  26. Ostash B., Kozarevska I., Fedorenko V. Generation of landomycin D-producing strain Streptomyces globisporus LD3 // Folia Microbiol.-2005.-Vol.50,N1.-P.19-23 [pdf, 217Kb].
  27. Oсташ Б.Е., Огонян С.В., Лужецкий А.Н., Бехтольд А., Федоренко В.А. Использование ПЦР для обнаружения в геномах актиномицетов генов, кодирующих поликетидсинтазы I типа // Генетика-2005.-Т.41,N5.-C.595-600 [pdf, 174Kb].
  28. Ostash B., Rix U., Remsing Rix L.L., Tao Liu, Lombo F., Luzhetskyy A., Gromyko O., Wang C., Brana A.F., Mendez C., Salas J.A., Fedorenko V., Rohr J. Generation of novel landomycins by combinatorial biosynthetic manipulation of the lndGT4 gene of the landopmycin E cluster in S. globisporus // Chemistry and Biology-2004.-Vol.11.-N.4.-P.547-555 [pdf, 645Kb].
  29. Gromyko O., Rebets Y., Ostash B., Luzhetskyy A., Fukuchara M., Bechtold A., Nakamura T., Fedorenko V. Generation of Streptomyces globisporus SMY622 strain with increased landomycin E production and it's initial characterization // J.Antibiot.-2004.-Vol.57.-N.6-P.383-389 [pdf, 292Kb].
  30. Luzhetskyy A., Lin T., Fedoryshyn M., Ostash B., Fedorenko V., Rohr J., Bechthold A. Function of lanGT3 a glycosyltransferase gene involved in landomycin A biosynthesis //Chembiochem.-2004.-Vol.5, N11.-P.1567- 1570 [pdf, 131Kb].

 

Навчальний процес | Наукові дослідження | Наукові конференції | Генетичний клуб | Генетичний гурток МАН | Викладачі і співробітники | Аспіранти | Студенти | Випускники кафедри | Новини Оголошення